Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms