Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn4Q9WU22 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms