Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnt3Q9QZ47 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms