Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms