Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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