Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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