Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms