Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clstn1Q9EPL2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms