Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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