Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms