Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnpy3Q9DAU1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnpy3Q9DAU1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms