Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift43Q9DA69 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms