Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp12Q9D9M2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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