Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp4bQ9D8B3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp4bQ9D8B3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms