Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Chchd2Q9D1L0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Chchd2Q9D1L0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms