Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2cQ9D1C1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms