Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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