Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms