Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms