Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ykt6Q9CQW1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms