Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms