Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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