Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndufb9Q9CQJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms