Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Use1Q9CQ56 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Use1Q9CQ56 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms