Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms