Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SmagpQ99KC7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SmagpQ99KC7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms