Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms