Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ddb2Q99J79 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ddb2Q99J79 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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