Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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