Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms