Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fbxo18Q8K2I9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fbxo18Q8K2I9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fbxo18Q8K2I9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fbxo18Q8K2I9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fbxo18Q8K2I9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fbxo18Q8K2I9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fbxo18Q8K2I9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fbxo18Q8K2I9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fbxo18Q8K2I9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo18Q8K2I9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms