Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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