Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma3Q8JZW8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms