Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms