Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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