Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nek11Q8C0Q4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms