Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms