Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc12Q8BW49 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc12Q8BW49 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms