Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Smarcal1Q8BJL0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Smarcal1Q8BJL0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Smarcal1Q8BJL0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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