Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms