Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp4Q8BFV3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms