Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms