Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc2bQ7TPM1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms