Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme8Q715T0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms