Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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