Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Arhgap20Q6IFT4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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