Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms