Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarca2Q6DIC0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarca2Q6DIC0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms