Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms