Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ift52Q62559 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms